日本仁孝天皇惠仁的受降仪式结束之后，惠仁和日本公卿及其家人正式被大汉关军押解出城，送入俘虏营专门关押。
再加上其他的居民和俘虏此前就已经全部押解出城，此时的京都城也正式被大汉占领军彻底清空了。
冯克善也正式下令开始按照计划改造京都城。
从城墙到房屋，从宫殿到庙宇，从神社到坟茔，从砖石到梁椽，从坛垣到石刻，全部彻底拆除，不要留下任何一个完整的设施乃至完整的地基。
京都城在日本古代的大部分时间都可以算是文化中心，特别是江户时代的日本天皇和公卿没有别的任务，主要职责就是研究学问。
京都城和宫殿内存有大量文献资料，还有大量图画和刻有文字的石碑。
大汉礼部按照刘玉龙的要求，安排了一批学者随军来到京都，专门检查核对这些书籍文献资料，以及所有带有文字的石碑和等物件。
所有单纯记载日本本地事务的文件全部销毁，石碑和刻有文字的岩壁都要把带字的部分挖出来，打碎之后用作浇灌混凝土建筑用的碎石。
所有单纯记载大汉本土事务的文献，或者是大汉本土传来的大汉文献，则要全部妥善保存下来，核对与中原本地留存文件的差异。
所有同时涉及到中原与日本事务的，若有悖逆之论者全部销毁，没有悖逆之论者可以保留下来，与各种文献典籍共同管理。
将整个京都城完全拆除，将所在地整体平整之后，开始按照大汉本土的中小城市标准，用拆除所获材料建设一座新城。
不再专门建设传统城墙，只需要建设最基本朝廷衙署设施，满足基本的军事争执需求和即可，至于民用工商业建筑按照需要建设。
京都城的所有拆除和重建工作，都由大汉民兵带领九州等其他地方的日本平民劳工负责，不会让大阪和京都地区的日本公卿、武士、浪人们负责。
天皇惠仁和公卿、武士、浪人们都算是比较特殊的俘虏，首先要全部押解到大阪城的军营附近，再根据他们的身份来分配和处置。
武士和浪人要装船运走，送到最为危险、脏乱、辛苦的矿山中劳作，要特别单独叮嘱，这一批要往往死里用。
大汉的劳役系统也有很多类型，通常有三个最基本的级别。
民兵定期服劳役的标准是最为轻松的。
通常是每两年持续服役三个月，服役的地点通常在家乡附近。
如果工作本身可能会比较辛苦乃至危险，那么每天都会至少两组人轮流工作。
每天工作时间通常只有六到八个小时。
这种劳役的休息时间就最为充分，还有服役补贴和各种各样的福利。
然后就是普通外族劳工和大汉的普通罪犯。
他们干的工作通常与民兵非常类似，但是服役时间将会是常年长期的，服役地点通常是海外蛮荒之地。
他们也没有民兵的服役补贴和福利，每天的工作时间通常是十到十二个小时。
不过他们能够获得充足的食物和御寒衣物，每年的死亡人数有限额，比例过高会影响管理官员的考核。
管理者需要保障他们能够长期工作，尽量不要把他们折腾死。
最后是以惩罚极端罪犯为目的劳役。
这些罪犯要承担最为危险、辛苦、肮脏的工作，死亡率限制非常宽甚至没有。
没有死亡率限制的劳工“可以”往死里用，甚至需要故意往死里用。
京都城内投降的这批武士和老人就是这个最低级别的劳工。
至于天皇惠仁和公卿们，倒是不会被直接送到海外的矿山去当劳工，因为他们是曾子城预定的诱饵。
冯克善也将这件事情直接交给了曾子城。
让曾子城率领军队将惠仁和公卿及其家人单独押解到大阪城去看押。
然后大阪城东北部的河畔平原地区选择一块区域，按照军营的标准搭建一处专门的俘虏营，临时关押这些特殊的俘虏。
然后调拨民兵和日本劳工将俘虏营改建为一座防御完善的“牢城”。
牢城外部应该是大汉关军的军营，内部则是一座大型综合监狱，监狱内要建设以劳动改造工厂，让惠仁和公卿们在工厂中持续劳作。
除了在工厂中劳作，他们还要负责牢城中的大部分杂活，包括打扫包括厕所在内的地区的卫生，包括处理粪便和垃圾。
将这些俘虏全部送走之后，冯克善留下一万关军驻扎在京都城城外，保护陆续赶来的民兵改造重建京都城。
其他主力部队分头行动，攻占京都周围的居民点，比较重要的目标是京都南方的山谷中的奈良。