江南的河网密布，柳清和便令工匠打造小型药舟，比药船更轻便，可驶入江南的小河汊，惠及偏远的水乡村落。小型药舟之上，仅载一名医者与一名学徒，携简易的药材与制药器具，行至村落，便义诊施药，教百姓制药。又与江南的药农合作，在太湖沿岸开辟药材基地，种植藿香、佩兰、莲子、芡实，所产药材皆由善益堂统一收购，药农的生计也愈发宽裕。
柳清和还将水上药坊沿长江而上，行至江州、鄂州，将江南的冷萃之法与防疫之术，传至长江中游。江州刺史见水上药坊的成效显著，便效仿苏州，刻防疫章程于石碑，立在长江码头，又拨出官船改造为药船，与柳清和的水上药坊一道，惠及长江沿岸的百姓。江南的水，温润绵长，善益堂的医药之泽，也如这江南的水一般，浸润着大唐的江南大地。
贞观十九年春，太宗亲征高句丽，临行前特召张云霄入殿，令善益堂派医者随行，供应军中医药。张云霄便令陈默、方砚、苏晚、柳清和各选十名得意弟子，携辽东的冷萃鹿油冻疮膏、西域的消炎化瘀液、岭南的辟瘴清暑液、江南的止泻健脾饮，随大军出征。
辽东的战场，冰雪尚未消融，将士们或为箭伤所苦，或为冻疮所困，善益堂的医者便在军中设立临时药营，以西域的消炎化瘀液治金疮，以辽东的冻疮膏治寒疾，以江南的止泻饮治军中肠疾，以岭南的辟瘴液预防军营疫疾。大军行至安市城，遇高句丽军突袭，数十名将士中箭，箭镞带毒，善益堂的医者先以冷萃麻醉液涂抹患处，拔箭后以消炎化瘀液清洗伤口，又以针灸为伤者排毒，竟让数十名将士皆脱离险境。
太宗见善益堂的医者医术精妙，军中伤亡大减，龙颜大悦，令军中将士皆尊善益堂医者为“医官”，凡医官所请，将士皆需配合。待征辽之战告捷，大军凯旋，太宗归至长安，第一件事便是再次嘉奖善益堂，赐黄金千两、锦缎百匹，又令将善益堂的医官之名，载入国史。
此时的长安善益堂总堂，已是大唐医者的圣地，国子监的医科开课，以《大唐冷萃药汇》《防疫备要》为典籍，四方学子皆慕名而来，国子监的医科生，从最初的数十人增至数百人，皆由秦御医、张云霄亲授，毕业后分赴大唐各道，入善益堂分堂，或入军中为军医，或入州县为医官。