随着顺义王遇刺，蒙古各部进一步分裂对立，明廷趁机加大对蒙古的管理和融合。
通过整编、联姻（前期主要是远支宗室和大臣，后期则招纳部落首领入京为官并许婚配，子嗣成年后返回卫所任职）、会盟、封赏、赈济、朝觐、重教等政策，加强对蒙古诸部上层人物及部民的笼络与辖治，并最终将外喀尔喀诸部纳入管理，在此基础上设立岭北都司，保障了地区二百余年的稳定。
万历五十年（1622年），蒙古诸部为万历帝上尊号“腾格里汗（天可汗）”，但是被他以“普天之下，莫非王土，朕乃天下万民之主，无需另上尊号”为由拒绝，自此，天下部族皆以皇帝称之。
此后，明廷还推行“以夷制夷”的周边政策，征召乌斯藏、岭北、朔方（宁夏等卫并土默特旧地改）和大宁等都司参与征讨吐鲁番等以收复西域故地、阻击沙俄哥萨克东进。对西南推行“改土归流”，趁内乱先后讨伐缅甸、暹罗，重设交趾布政使司。
此外，还组织远征船队从永宁出发，经流鬼半岛发现了泰昌海峡（大陆与海东之间的海峡），经安东群岛（土著称阿留申群岛）抵达海东（泰西人称“美洲”）。虽大部分目标得以实现，但多年征伐也导致民力不支，至十八世纪中后期，除了继续开拓移民海东外，其他征讨都逐渐停止。
后面这些事情，秀保自然是看不到了，更不能左右，不过他自认已经尽力，后续如何，听从天命。
返回日本后，明廷赏赐络绎不绝，勘合贸易更是全面放宽，日本的经济社会加速恢复发展，秀保的威望也与日俱增，这在丰臣宗家看来，似乎不是什么好事。
庆长十八年（1613年）正月中，池田辉政病逝，为开年蒙上了一层阴影，这位秀保甚为倚重的丰臣旧臣，临终前将春日山藩四十一万石交给了嫡子池田利隆，秀保虽然同意，可心中难免担忧，这样的大大名今后在日本扮演什么样的角色，很难做出准确判断。
这年，秀赖年满二十岁，而他的官职却始终停留在右大臣。反而是秀保的几个儿子，嫡子（16岁）晋位权大纳言，长子（17岁）晋位中纳言，这让宗家和秀保之间的关系颇为微妙，甚至是有些紧张。
秀保之所以如此，也是秀赖咎由自取。多年来，他的性情没有多少改变，暴戾之气也未有收敛，这时候适当敲打敲打，秀保自以为能让他有所警醒。
但秀赖却并未体会到这点，反而因为传闻“菊亭晴季即将担任关白”而更加憎恨秀保，进而暗中联络石田三成和增田长盛，意图于丰臣秀吉忌日行刺秀保。
三成大惊，立即写信阻止，增田长盛也命次子回信秀赖，让其切莫听信风言风语，继续忍耐。
然而次子担心惹祸上身，竟然将书信交于长崎奉行后藤基次，基次得信后立即派人告知秀保。
秀保虽然愤怒，但还是要顾及宗家的颜面，他拒绝了家臣提出的让秀赖亲自前往伏见说明情况的提议。
“叫了这么多年的‘少主’，现在让他来伏见向我谢罪，总觉得有些不妥。”秀保心中有所顾虑。