统帅部下面按军种分设海陆空三军总司令部，总司令皆由国防部长即欧阳云担任，副司令级别的高级军官方面，学兵军入职的人员有，蒋光鼐任陆军第三副总司令，楚天歌任陆军第五副总司令，李铁书任陆军第二副总参谋长；铁林飞任空军第二副总司令，王海任空军第三副总司令；陈策任海军第一副总司令，陈师昌任海军第三副总司令，陈远洋任海军第二副总参谋长，三军总司令部下面，是仅次半级的战略司令部，欧阳云提出成立战略司令部，冯玉祥和李宗仁等人曾表示不解，而欧阳云在一再嘱咐他们保密，然后亮出最新型的地对地导弹以后，他们才明白了该单位的重要性，战略司令部不仅辖制导弹部队，而且还将全权负责反谍战和情报工作，该单位成立以后，将会设两个下属部门，一为中央情报局，再就是战略防御办公室，战略司令部总司令由木剑蝶担任，常根则任中央情报局局长，战略防御办公室主任则由顾恋云担任，
统帅部取代军事委员会，军事委员会时期的战区自然也要重新划分，这正是这次会议的中心议題，在欧阳云相继宣读了冯玉祥、陈诚、李宗仁、邓锡侯等人在统帅部的任命以后，这个议題随即被提上议事日程，冯玉祥最终沒能得偿所愿，不过，陆军第一副总司令，加上欧阳云答应拨给他一个警卫师的编制，也算是对他这位老前辈给出了不错的交代，所有人的任命里，事关陈诚的算是焦点，陈诚不仅出任副国防部长，而且还将兼任陆军总参谋长，而土木系除了他之外还有两个人获准入职统帅部，他们分别是担任统帅部军情咨询室室长的林蔚，再就是出任空军总参谋长的周至柔，
欧阳云关于统帅部司令级别的高级军官的任命，其实是政治上的妥协的结果，任命宣布毕，自然有人欢喜有人忧，也有不屑一顾的，不过好在沒有人当场提出质疑，这也算是陈诚出任副国防部长带來的好处之一了，
有关战区的重新划分，实际上关系到各派将來的生存和发展空间，至少，与会的人里面十有**是这么想的，所以当欧阳云一宣布出來，本來还在交头接耳的立刻闭嘴不言，本來端坐着的也不禁身子挺直，一个个正襟危坐，变得慎重其事起來，
在联合政府组建前，按照军事委员会的划分，全国一共被划分为十二个战区，军事委员会当时划分战区的标准是完全以地域为标准，而随着战事的进展，很多战区实际上已经全部被日军占领，部队也不得不退往后方或者进入别的战区，说得不客气一点，这些战区等于失去立足之本，实际上已经可以取缔了，老蒋当时沒有这么做，那么现在欧阳云呢，这是所有人关注的焦点，